Stellenausschreibung Nr. 772
Die Abteilung „Bioinformatik der Infektionsforschung“ unter der Leitung von Prof. Dr. Alice C. McHardy am Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung (HZI) schreibt folgende Stelle aus:
Postdoc-Stelle im Bereich computergestützte Metagenomik (m/w/d)
Als Mitglied der Helmholtz-Gemeinschaft betreibt das Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung mit Sitz in Braunschweig Spitzenforschung auf dem Gebiet der Infektionskrankheiten. Unsere Wissenschaftler_innen entwickeln neuartige Methoden und Strategien, um Infektionskrankheiten schneller und wirksamer zu bekämpfen. Unser gemeinsames Ziel ist es, neue Ansätze zur Prävention, Diagnose und Behandlung von Infektionskrankheiten zu entwickeln. Im Mittelpunkt unserer Forschung stehen bakterielle und virale Krankheitserreger, deren Wechselwirkungen mit dem menschlichen Immunsystem sowie neue wirksame Wirkstoffe und Impfstoffe.
Die Abteilung „Bioinformatik der Infektionsforschung“ untersucht das menschliche Mikrobiom sowie virale und bakterielle Krankheitserreger unter Einbeziehung biomedizinischer Metadaten. Hierfür analysiert sie umfangreiche biologische und epidemiologische Datensätze mithilfe computergestützter Methoden. Zur Erreichung ihrer Forschungsziele entwickelt die Abteilung zudem neuartige Algorithmen und Software.
Ein besonderer Schwerpunkt unserer Arbeit ist die Beteiligung an Critical Assessment of Metagenome Interpretation (CAMI), einer internationalen Initiative, die computergestützte Methoden zur Metagenomanalyse systematisch anhand von Benchmarks vergleicht und deren Weiterentwicklung vorantreibt. CAMI beteiligt sich außerdem an NFDI4Microbiota, einem DFG-geförderten Konsortium, das sich dem Aufbau nachhaltiger Forschungsdateninfrastrukturen und der Förderung FAIR-konformer Datenpraktiken innerhalb der mikrobiologischen Forschungsgemeinschaft widmet. Im Rahmen dieser Initiativen arbeiten wir eng mit nationalen und internationalen Partnern und Partnerinnen zusammen, um Standards, Methoden und Ressourcen für die Mikrobiom- und Metagenomforschung weiterzuentwickeln.
Ihre Aufgaben umfassen unter anderem:
- Entwicklung und Bewertung innovativer Forschungsmethoden im Rahmen der CAMI-Initiative, einschließlich der Erstellung komplexer, realitätsnaher und umfassender Metagenom- und Metatranskriptom-Benchmark-Datensätze
- Erweiterung der Benchmarking-Frameworks des CAMI-Portals sowie der zugehörigen Software zur Benchmark-Auswertung
- Einbindung der breiteren Metagenomik-Forschungsgemeinschaft in die Benchmarking-Aktivitäten von CAMI
- Aktive Mitarbeit in NFDI4Microbiota durch die Weiterentwicklung von nachhaltigen Benchmarking-Ressourcen, Standards der Forschungsgemeinschaft und FAIR-konformen Datenpraktiken
- Veröffentlichung der Forschungsergebnisse in Fachzeitschriften mit Peer-Review-Verfahren sowie Präsentation Ihrer Arbeit auf nationalen und internationalen wissenschaftlichen Tagungen
- Mitwirkung bei der Einwerbung von Drittmitteln oder bei Lehraktivitäten der Abteilung (bis zu 25 % der Arbeitszeit)
Ihre Qualifikationen und Fähigkeiten:
- Abgeschlossene Promotion in Informatik, Bioinformatik, Statistik, maschinellem Lernen oder einem vergleichbaren Fachgebiet
- Vorerfahrung mit dem Forschungsthema und Engagement für reproduzierbare Forschung
- Gute Programmierkenntnisse, ausgeprägtes analytisches Denkvermögen und Problemlösungskompetenz
- Selbstständige, strukturierte und zielorientierte Arbeitsweise sowie Team- und Kommunikationsfähigkeit
- Ausgezeichnete Englischkenntnisse in Wort und Schrift
Wir bieten Ihnen:
- Eine attraktive und abwechslungsreiche Tätigkeit in einem zukunftsorientierten Forschungsinstitut mit einem internationalen Umfeld am Science Campus Süd in Braunschweig
- Eine hochmoderne Infrastruktur und modernste Technologien
- Flexible Arbeitszeitgestaltung, Teilzeitmodelle sowie Homeoffice
- Eine Unternehmenskultur der Wertschätzung und Förderung der Chancengleichheit
- Umfangreiche Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten zur Entwicklung fachlicher Kenntnisse und persönlicher Fähigkeiten
- Ein Familienbüro zur Unterstützung von Familie und Beruf, sowie Angebote für eine verbesserte Kinderbetreuung bspw. auch in den Ferien
- Interessante Zusatzleistungen des öffentlichen Dienstes
- Möglichkeit eines Arbeitgeberzuschusses zum Jobticket
Bei gleicher fachlicher Eignung erhalten Schwerbehinderte den Vorzug. Um Ihre Rechte zu wahren, bitten wir Sie, uns einen deutlichen Hinweis auf das Vorliegen einer Schwerbehinderung in Ihrem Anschreiben oder Lebenslauf zu geben.
Das HZI engagiert sich aktiv für Gleichstellung, Vielfalt und Integration. Aus diesem Grund verfolgt das HZI das Ziel der beruflichen Gleichstellung von Frauen und Männern. Die Stelle ist teilzeitgeeignet.
Für weitere Informationen wenden Sie sich bitte an Dr. Carmen Paulmann, E-Mail: carmen.paulmann@helmholtz-hzi.de.
Bitte fügem Sie Ihren Bewerbungsunterlagen ein Anschreiben, einen Lebenslauf, eine Darstellung Ihrer Forschungsinteressen, Zeugnisse, Kopien Ihrer wichtigsten Publikationen sowie die Kontaktdaten von zwei oder drei Referenzpersonen bei. Bitte verzichten Sie auf die Einsendung eines Fotos.
Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung!